2012年10月18日，为了落实2012年财政部、教育部和北京市政府与中央财经大学的共建目标，在国务院医改办、财政部、发改委、人力资源和社会保障部、卫生部、世界银行、世界卫生组织、联合国儿童基金会以及地方有关部门长期大力支持下，由中国财政发展协同创新中心、财政学院、“医疗卫生改革政策评价与老龄健康研究跨学科创新”团队等机构，共同组建成立了“公共卫生经济与管理研究所”。“公共卫生经济与管理研究所”现有校内外专家、研究人员20余人，依托高校与政府，国内与国外等多方资源优势，具有承担公共卫生经济与管理重大课题研究、政策咨询和设计的能力。研究所致力于开辟公共卫生经济与管理学科理论与实践的前沿试验区域，同时，通过构建国际公共卫生经济与管理的高水平研究平台，成为国内具有一定影响的公共卫生经济与管理研究机构、中国公共卫生经济领域政府决策部门的智库，并成为国内经济和公共卫生领域中有重要影响的专业培训机构和学术后备人才的创新培养基地。